Gomez C, Neira M, Hernandez M, Arbelaez P, Forero-Romero J.E.. (2020)
Classifying Image Sequences of Astronomical Transients with Deep Neural Networks
MONTHLY NOTICES OF THE ROYAL ASTRONOMICAL SOCIETY (ISSN 1365-2966)
Artículo
Marcela Hernandez Hoyos
Marcela Hernandez Hoyos
Docteur De L'Institut National Des Sciences Apliquees De Lyon Spécialité: Images Et Systemes
marc-her @uniandes.edu.co
Profesor Asociado
Oficina: ML-315
Extensión: 2866
Perfil
Marcela Hernández Hoyos recibió su diploma de pregrado en 1993 y de maestría en 1996, ambos en Ingeniería de Sistemas y Computación de la Universidad de los Andes. En 1998 obtuvo un segundo diploma de maestría en Ingeniería Biomédica otorgado por el Instituto Nacional de Ciencias Aplicadas (INSA) de Lyon, Francia. Posteriormente realizó estudios de doctorado en la misma institución con financiación de la industria. En 2002 obtuvo su diploma de PhD con honores. El principal resultado de su trabajo de doctorado es el software llamado MARACAS (MAgnetic Resonance Angiography Computer Assisted AnalysiS), el cual fue objeto de una transferencia industrial que culminó con una venta a la compañía Hitachi en Japón. Desde 2004 se desempeña como profesora e investigadora del Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación de la Universidad de Los Andes. En investigación, su principal área de interés es el procesamiento de imágenes biomédicas con especial énfasis en patologías pulmonares, vasculares y neurodegenerativas y en docencia, la enseñanza de la programación. Entre sus logros más importantes de investigación se encuentra la otorgación de una patente de invención (en Japón, Estados Unidos y Comunidad Europea) sobre un método de cuantificación de tejido adiposo abdominal. En el ámbito académico la profesora Hernández ha sido reconocida permanentemente por sus cualidades docentes. En la actualidad, tiene a su cargo la coordinación de los cursos de programación de la Universidad de los Andes y ha desarrollado múltiples innovaciones pedagógicas en dichos cursos, las cuales se han visto materializadas en la creación de un MOOC de Coursera, el cual fue catalogado como uno de los 20 mejores MOOCs lanzados en el 2017 según la plataforma Central-Class (entre más de 2000 cursos evaluados). Entre el 2009 y el 2012 se desempeño como Subdirectora del Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación y posteriormente como Vicedecana Académica de la Facultad de Ingeniería.
Cursos Recientes
- 2021
INTRODUCCIÓN A LA PROGRAMACIÓN
Primer Periodo
Licenciatura
- 2020
IMÁGENES Y VISION
Segundo Periodo
Maestría
Productos Recientes
Neira M, Gomez C, John F. Suárez-Pérez, Gomez D, Reyes J, Hernandez M, Arbelaez P, Forero-Romero J.E.. (2020)
MANTRA: A Machine-Learning reference light-curve dataset for astronomical transient event recognition
Astrophysical Journal Supplement Series (ISSN 1538-4365)
Artículo
Títulos Académicos Recientes
Docteur De L'Institut National Des Sciences Apliquees De Lyon Spécialité: Images Et Systemes
Doctorado
Institut National Des Sciences Apliquees De Lyon
2003
Francia
Diplome D'Études Approfondies Formation Genie Biologique Et Médical
Maestría
Institut National Des Sciences Apliquees De Lyon
1999
Francia
Proyectos Recientes
- 2011
- DETENCION DE ANOMALIAS EN ARBOLES VASCULARES
Duración: 36 meses
PRY-585
Modelo del arbol vascular coronario a partir de imagnes TAC 3D Y T para cuantificacion del porcentaje de estenosis coronaria en presencia de palcas altamente calificadasDuración: 24 meses
PRY-516
Cursos
- 2021
INTRODUCCIÓN A LA PROGRAMACIÓN
Primer Periodo
Licenciatura
- 2020
- 2019
- 2018
- 2017
- 2016
- 2015
- 2014
- 2013
- 2012
- 2011
Productos
Gomez C, Neira M, Hernandez M, Arbelaez P, Forero-Romero J.E.. (2020)
Classifying Image Sequences of Astronomical Transients with Deep Neural Networks
MONTHLY NOTICES OF THE ROYAL ASTRONOMICAL SOCIETY (ISSN 1365-2966)
Artículo
Neira M, Gomez C, John F. Suárez-Pérez, Gomez D, Reyes J, Hernandez M, Arbelaez P, Forero-Romero J.E.. (2020)
MANTRA: A Machine-Learning reference light-curve dataset for astronomical transient event recognition
Astrophysical Journal Supplement Series (ISSN 1538-4365)
Artículo
Mendoza R, Puentes John, Luis, Hernandez M. (2020)
Single-slice Alzheimer's disease classification and disease regional analysis with Supervised Switching Autoencoders
Computers in Biology and Medicine (ISSN 0010-4825)
Artículo
Hernandez M, Rosales E, Suarez J, Calderon J.
CupiReservas
Dirección Nacional de Derecho de Autor.
Software
Mendoza R, Uriza L, Douek P, Hernandez M.
METHOD FOR AUTOMATIC SEGMENTATION OF BODY TISSUES
European Patent Office.
INDUSTRIAL_DESIGN
Laurent Bitker, Nicolas Costes, Didier Le Bars, Franck Lavenne, Maciej, Hernandez M, Nazim Benzerdjeb, Devouassoux M, Richard J. (2019)
Noninvasive quantification of macrophagic lung recruitment during experimental ventilation-induced lung injury
Journal of Applied Physiology (ISSN 8750-7587)
Artículo
Richard J, ORKISZ M., Hernandez M, Morales A, Guerin C. (2019)
Proceedings of Reanimation 2019, the French Intensive Care Society International Congress France. 23-25 January 2019 Abstracts
Annals of Intensive Care (ISSN 2110-5820)
Artículo
ORKISZ M., Morales Pinzón A, Richard J, Guerin C, Solórzano Vargas L.E., Sicaru Daniela, Garcia C, Gómez Ballén M.M., Neyran B, Davila-serrano E, Hernandez M. (2019)
Voxel-wise assessment of lung aeration changes on CT images using image registration: application to acute respiratory distress syndrome (ARDS)
INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY (ISSN 1861-6429)
Artículo
Hernandez M.
CAAVAT: Method for the automatic segmentation and quantification of body tissues
United States Patent and Trademark Office.
INDUSTRIAL_DESIGN
Hernandez M.
Method for the automatic segmentation and quantification of body tissues
Ministry of Economy, Trade and Industry.
INDUSTRIAL_DESIGN
Morales Pinzón A, Hernandez M, Richard J, Flórez-Valencia L, Orkisz M. (2017)
A tree-matching algorithm: Application to airways in CT images of subjects with the acute respiratory distress syndrome
Medical Image Analysis (ISSN 1361-8415)
Artículo
Kristína Lidayová, Gomez D, Hernandez M, Frimmel H, ORKISZ M., Örjan Smedby. (2017)
Airway-Tree Segmentation in Subjects with Acute Respiratory Distress Syndrome
20th Scandinavian Conference, SCIA 2017
Capítulo en Memoria
Buitrago F, Casallas R, Hernandez M, Reyes A, Restrepo S, Danies G. (2017)
Changing a Generation’s Way of Thinking: Teaching Computational Thinking Through Programming
Review of Educational Research (ISSN 0034-6543)
Artículo
Suarez J, Hernandez M, ROSALES E, Cortes G, Montañez C, Agudelo C, Saavedra C.
CupiExamenes
Dirección Nacional de Derecho de Autor.
Software
Caldas S .Exploración de machine learning como técnica de segmentación pulmonar en presencia de opacidades de gran tamaño. (2017).
Exploración de machine learning como técnica de segmentación pulmonar en presencia de opacidades de gran tamaño
Tesis
Hernandez M, Reyes J, Gómez A.
MOOC Coursera - Introducción a la programación orientada a objetos en Java
Otro(s)
Chaves N .Reconstrucción del árbol bronquial en pacientes con Síndrome de Deficiencia Respiratoria Aguda. (2017).
Reconstrucción del árbol bronquial en pacientes con Síndrome de Deficiencia Respiratoria Aguda
Tesis
Hernandez S .Segmentation of the aorta artery for applications such as the elasticity quantification and the calcifications volume quantification. (2017).
Segmentation of the aorta artery for applications such as the elasticity quantification and the calcifications volume quantification
Tesis
Morales A, Gomez D, Solórzano Vargas L.E., Richard J, Orkisz M, Hernandez M. (2016)
A novel hybrid registration method: Application to lung segmentation in CT images of subjects with ARDS
VIII Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica
Capítulo en Memoria
Gomez D, Anna Fabijanska, Florez Valencia L, Morales A, Dávila Serrano E.E., Richard J, ORKISZ M., Hernandez M. (2016)
Airway segmentation, skeletonization, and tree matching to improve registration of 3D CT images with large opacities in the lungs
International Conference, ICCVG 2016,
Capítulo en Memoria
Mendoza R, González Fabio A., Arbelaez P, Puentes John, Hernandez M. (2016)
Analysis of PHOW representations for Alzheimer disease classification on brain structural MRI
ISBI 2016
Capítulo en Memoria
Suarez J .Bison Wasp: plataforma para la ejecución de flujos de trabajo científicos. (2016).
Bison Wasp: plataforma para la ejecución de flujos de trabajo científicos
Tesis
Gonzalez J .Diseño e implementación de un módulo de visualización e interacción WEB. (2016).
Diseño e implementación de un módulo de visualización e interacción WEB
Tesis
Mendoza R, Puentes John, González Fabio A., Hernandez M. (2016)
Empirical evaluation of general-purpose image features for pathology-oriented image retrieval of Alzheimer Disease cases
Computer Assisted Radiology and Surgery - 30th International Congress and Exhibition CARS 2016
Capítulo en Memoria
Solórzano Vargas L.E., Morales A, Richard J, Orkisz M, Hernandez M. (2016)
Localized visualization and quantification of pulmonary parenchyma properties in CT scans in presence of Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS)
VIII Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica
Capítulo en Memoria
Morales A .Lung segmentation and airway tree matching: Application to aeration quantification in CT images of subjects with ARDS. (2016).
Lung segmentation and airway tree matching: Application to aeration quantification in CT images of subjects with ARDS
Tesis
Hernandez M.
MÉTODO PARA LA SEGMENTACIÓN Y CUANTIFICACIÓN AUTOMÁTICA DE TEJIDOS CORPORALES
Universidad de los Andes, Hospital Universitario San Ignacio, Hospices Civils de Lyon.
INDUSTRIAL_DESIGN
Solorzano L .Localized visualization, analysis and quantification of pulmonary parenchyma deformations in 3D images in presence of acute respiratory distress syndrome (ARDS). (2015).
Localized visualization, analysis and quantification of pulmonary parenchyma deformations in 3D images in presence of acute respiratory distress syndrome (ARDS)
Tesis
Montañes D .Machine learning applied to the diagnosis of neurodegenerative diseases based on medical images. (2015).
Machine learning applied to the diagnosis of neurodegenerative diseases based on medical images
Tesis
Florez Valencia L, Morales A, Richard J, Hernandez M, Orkisz M. (2015)
Simultaneous skeletonization and graph description of airway trees in 3D CT images
GRETSI 2015
Capítulo en Memoria
Morales A, Orkisz M, Richard J, Guérin Claude, Hernandez M. (2014)
"Lung segmentation in 3D CT Images of Induced Acute Respiratory Distress Syndrome", MICCAI NCIGT and NIH Image Guided Therapy Workshop, Boston, USA, pp. 51, 09/2014 .
Otro
Correa E, Florez Valencia L, Orkisz M, Mouton C, Dávila Serrano Eduardo E., Hernandez M. (2014)
A Modular Workflow Architecture for Coronary Centerline Extraction in Computed Tomography Angiography Data
International Conference on Computer Vision and Graphics ICCVG 2014
Capítulo en Memoria
Morales A, Orkisz M, Rodriguez C, Torres J, Teillaud S, Sanchez J, Hernandez M. (2014)
A Semi-Automatic Method to Extract Canal Pathways in 3D Micro-CT Images of Octocorals
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Artículo
Correa E, Hernandez M, Florez Valencia L, Orkisz M. (2014)
An Interactive Coronary Centerline Extraction Framework for CTA Image Analysis
VII Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica
Capítulo en Memoria
Rina D. Rudyanto, Sjoerd Kerkstra, Eva M. van Rikxoort, Catalin Fetita, Pierre-Yves Brillet, Christophe Lefevre, Wenzhe Xue, Xiangjun Zhu, Jianming Liang, İlkay Öksüz, Devrim Ünay, Kamuran Kadipaşaogˇlu, Raúl San José Estépar, James C. Ross, George R. Washko, Prieto J, Hernandez M, Orkisz M, Hans Meine, Markus Hüllebrand, Christina Stöcker, Fernando Lopez Mir, Valery Naranjo, Eliseo Villanueva, Marius Staring, Changyan Xiao, Berend C. Stoel, Anna Fabijanska, Erik Smistad. (2014)
Comparing algorithms for automated vessel segmentation in computed tomography scans of the lung: the VESSEL12 study
Medical Image Analysis (ISSN 1361-8415)
Artículo
Florez N .Estudio comparativo de descriptores numéricos para recuperación de imágenes médicas basada en contenido. (2014).
Estudio comparativo de descriptores numéricos para recuperación de imágenes médicas basada en contenido
Tesis
Zuluaga M.A., Hernandez M, Orkisz M. (2014)
Feature selection based on empirical-risk function to detect lesions in vascular computed tomography
IRBM - Innovation and Research in BioMedical Engineering (ISSN 1959-0318)
Artículo
Morales A, Orkisz M, Richard J, Guérin Claude, Hernandez M. (2014)
Lung segmentation in 3D CT Images of Induced ARDS
MICCAI Workshop: NCIGT and NIH Image Guided Therapy Workshop
Capítulo en Memoria
Morales A, Orkisz M, Richard J, Hernandez M. (2014)
Lung segmentation in 3D CT images from induced Acute Respiratory Distress Syndrome
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI
Capítulo en Memoria
Morales A, Hernandez M, Richard J, Torres González J, Orkisz M. (2014)
Quantification of Aeration in 3D CT Images from Induced Acute Respiratory Distress Syndrome
VII Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica
Capítulo en Memoria
Richard J, Pouzot C, Morales A, Torres González J, Orkisz M, Neyran B, Hernandez M, Lavenne F, Guerin C. (2014)
Reliability of the nitrogen washin-washout technique to assess end-expiratory lung volume at variable PEEP and tidal volumes
Intensive Care Medicine Experimental ()
Artículo
Orkisz M, Hernandez M, Pérez V, Pérez C, Prieto J, Revol-muller C. (2014)
Segmentation of the pulmonary vascular trees in 3D CT images using variational region-growing
IRBM - Innovation and Research in BioMedical Engineering (ISSN 1959-0318)
Artículo
Mouton C, Dávila Serrano E.E., Cervenansky F, Camarasu-pop S, Correa E, Florez Valencia L, Hernandez M, Orkisz M. (2013)
CreaTools: A development framework for medical image processing software ; an application to segmentation, anomaly detection and quantification for coronary arteries
European BioImage Analysis Symposium 2013
Capítulo en Memoria
Correa E .Semi-automatic Coronary Calcification Detection in Computed Tomography Images. (2013).
Semi-automatic Coronary Calcification Detection in Computed Tomography Images
Tesis
Torres J .Static Segmentation of Thoracic Structures for the Quantification of Pulmonary Aeration in 3D CT Images in presence of Acute Respiratory Distress Syndrome. (2013).
Static Segmentation of Thoracic Structures for the Quantification of Pulmonary Aeration in 3D CT Images in presence of Acute Respiratory Distress Syndrome
Tesis
Reyes J .Volume Rendering Interactive Metawidget of Heart and Coronary Arteries. (2013).
Volume Rendering Interactive Metawidget of Heart and Coronary Arteries
Tesis
Zuluaga M, Hernandez M, Dávila J, Uriza L, Orkisz M. (2012)
A fast lesion registration to assist coronary heart disease diagnosis in CTA images
International Conference on Computer Vision and Graphics
Capítulo en Memoria
Gutiérrez F, Corredor R, Zuluaga M, Hernandez M, Orkisz M. (2012)
Aprendizaje de máquinas basado en bosques aleatorios para la segmentación automática de la arteria carótida en imágenes de TAC
Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica
Capítulo en Memoria
Mendoza R, Douek P, Uriza L, Hernandez M. (2012)
CAAVAT: Análisis asistido por computador del tejido adiposo visceral en imágenes TAC
Congreso Colombiano de Radiología
Capítulo en Memoria
Mendoza R, Uriza L, Douek P, Hernandez M. (2012)
CAAVAT: Computer Assisted Analysis of Visceral Adipose Tissue on CT images
RSNA 98th Scientific Assembly and Annual Meeting
Capítulo en Memoria
Florez L, Orkisz M, Corredor R, Torres J, Correa E, Mouton C, Hernandez M. (2012)
Coronary artery segmentation and stenosis quantification in CT images with use of a right generalized cylinder model
MICCAI-Workshop on 3D Cardiovascular Imaging Segmentation Challenge
Capítulo en Memoria
Davila-serrano E, Guigues L, Roux J, Cervenansky F, Mouton C, Camarasu-pop S, Florez L, Hernandez M, Orkisz M. (2012)
Crea Tools: a and development framework for medical image-processing software
Libre Software Meeting
Capítulo en Memoria
Prieto J, Revol-muller C, Odet C, Orkisz M, Hernandez M. (2012)
CreaLungs: a variational region growing method to segment pulmonary vascular trees
ISBI VESSEL12 Challenge
Capítulo en Memoria
Davila-serrano E, Guigues L, Roux J, Cervenansky F, Pop S, Florez L, Hernandez M, Orkisz M. (2012)
CreaTools1: applications and development framework for medical image-processing software
ISBI Workshop on Open Source Medical Image Analysis software
Capítulo en Memoria
Davila-serrano E, Guigues L, Roux J, Cervenansky F, Pop S, Riveros J, Florez L, Hernandez M, Orkisz M. (2012)
CreaTools: a framework to develop medical image processing software. Application to simulate pipeline stent deployment in intracranial vessels with aneurysms
International Conference on Computer Vision and Graphics
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Davila-serrano E, Correa E, Torres J, Corredor R, Gutiérrez F, Florez L, Mouton C, Orkisz M. (2012)
CreaTools: una plataforma para desarrollo de software de procesamiento de imágenes médicas. Aplicación a la segmentación de arterias coronarias y a la detección automática de lesiones en imágenes de angioTAC
Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095)
Artículo
Mendoza R, Uriza L, Douek P, Hernandez M. (2012)
Outil d'aide au diagnostic du syndrome métabolique : Segmentation automatique du tissu adipeux viscéral
Journées Francaises de Radiologie
Capítulo en Memoria
Mendoza R, Caicedo I, Gomez B, Uriza L, Hernandez M. (2012)
Potencial y viabilidad de la adquisición con Medipix2 para la caracterización de la pared arterial y del ateroma
Congreso Colombiano de Radiología
Capítulo en Memoria
Corredor R, Zuluaga M, Lozano F, Orkisz M, Hernandez M. (2012)
Segmentación de lumen arterial mediante Support Vector Machines en imágenes de TAC
Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica
Capítulo en Memoria
Prieto J, Pérez C, Perez V, Revol-muller C, Odet C, Orkisz M, Hernandez M. (2012)
Segmentation of the pulmonary vascular tree
CLEI 2012
Capítulo en Memoria
Iragorri A, Rosas L, Filizzola C, Cano C, Uriza L, Reyes P, Hernandez M, Matallana D. (2011)
Alteraciones en el comportamiento alimentario asociados con la pérdida del grosor de la corteza cerebral en la demencia frontotemporal
Revista Colombiana de Psiquiatría (ISSN 0034-7450)
Artículo
Gutiérrez F, Ortega D, Orkisz M, Uriza L, Hernandez M. (2011)
Automatic Segmentation of Pulmonary Arterial Tree in Computer Tomography Images
Sexto Congreso Colombiano de Computación
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Magnin I, Hernandez M, Delgado E, Lozano F, Orkisz M. (2011)
Automatic detection of abnormal vascular cross-sections based on density level detection and support vector machines
Computer-Assisted Radiology and Surgery (ISSN 1861-6410)
Artículo
Mendoza R, Sánchez A, Uriza L, Hernandez M. (2011)
Automatic segmentation of adipose viseral tissue from CAT images, employing anatomical invariants
Sexto Congreso Colombiano de Computación
Capítulo en Memoria
Hameeteman K, Zuluaga M, Freiman M, Joskowicz L, Cuisenaire O, Florez L, Gulsun M, Krissian K, Mille J, Wong W, Orkisz M, Tek H, Hernandez M, Benmansour F, Chung A, Rozie S, Van M, Van L, Sosna J, Berman P, Cohen N, Douek P, Sanchez I, Aissat M, Schaap M, Metz C, Van A, Krestin G, Niessen W, Van T. (2011)
Evaluation framework for carotid bifurcation lumen segmentation and stenosis grading
Medical Image Analysis (ISSN 1361-8415)
Artículo
Hernández J, De C, Hernandez M, Hernandez J. (2011)
Fast Automated Detection and Interactive Analysis of Simultaneous CMEs on Stereo COR-2 Beacon Data
6o Congreso Colombiano de Computación
Capítulo en Memoria
Hernández J, Pérez C, Hernandez M. (2011)
Fast Automated detection of CMEs fronts relevant for the Space Weather Program
Sexto Congreso Colombiano de Computación
Capítulo en Memoria
Oscar Gonzalez-Rojas, Hernandez M. (2011)
Informe de Actividades 2010: Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación
Otro
Zuluaga M, Hush D, Delgado E, Hernandez M, Orkisz M. (2011)
Learning from Only Positive and Unlabeled Data to Detect Lesions in Vascular CT Images
Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions
Capítulo en Memoria
López D, Triana J, Martínez A, Hernandez M, Ortiz P. (2011)
Mixing Distribution Pattern In a Glass Packed Bed As a Function of Hydrophobic/Hydrophilic Surface Treatment
AIChE 2011 Anual Meeting October 16-21
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Orkisz M, Delgado E, Dore V, Morales A, Hernandez M. (2010)
Adaptación del algoritmo MARACAS para la segmentación de la bifurcación de la carótida
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Artículo
Wilches D, Rodriguez D, Ortiz P, Hernandez M. (2010)
Análisis automático de imágenes aplicado a la caracterización microestructural de piezas pulvimetalúrgicas
Quinto Congreso Colombiano de Computación
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Delgado E, Hernandez M, Orkisz M. (2010)
Can the coronary artery centerline extraction in computed tomography images be improved by use of a partial volume model?
International Conference on Computer Vision and Graphics
Capítulo en Memoria
Morales A, Orkisz M, Teillaud S, Hernandez M, Sanchez J. (2010)
Extracción semi-automática de ejes de canales de corales
VI Seminario Internacional de Procesamiento y Análisis de Imágenes Médicas
Capítulo en Memoria
Hernández J, Lugaz N, Pérez C, Hernandez M, Roussev I. (2010)
Fast method to determine CMEs properties at 1 AU and propositions for an automated detection of CME fronts
2010 American Geophysical Union (AGU) Fall Meeting
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Delgado E, Hernandez M, Orkisz M. (2010)
Feature Selection for SVM-based Vascular Anomaly Detection
MICCAI Workshop on Medical Computer Vision
Capítulo en Memoria
Manzur L, Vargas J, Hernandez M, Figueroa P. (2010)
Identificación del movimiento ocular en videos convencionales
Quinto Congreso Colombiano de Computación
Capítulo en Memoria
Moreno S, Caicedo S, Strulovic T, Briceño J, Briceño F, Gomez S, Hernandez M. (2010)
Inferior Maxillary Bone Tissue Classification in 3D CT Images
International Conference on Computer Vision and Graphics
Capítulo en Memoria
Cadena N, Rey C, Hernandez M, Teillaud S, Ardila N, Sanchez J, Sanchez J. (2010)
Linking local to global properties in branching modular networks: gorgonian coral colonies
Marine Biology (ISSN 0025-3162)
Artículo
Hernandez M.
MODELO DEL ÁRBOL VASCULAR CORONARIO A PARTIR DE IMAGENES TAC 3D + T PARA CUANTIFICACIÓN DEL PORCENTAJE DE ESTENOSIS CORONARIA EN PRESENCIA DE PLACAS ALTAMENTE CALCIFICADAS
Colciencias.
Propuesta
Moreno S, Strulovic T, Gómez S, Briceño J, Briceño F, Hernandez M. (2010)
Segmentación del tejido óseo en el hueso maxilar inferior en imágenes TAC 3D
Quinto Congreso de Computación
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Orkisz M, Hernandez M, Lozano F, Magnin I. (2010)
Towards vascular abnormality detection: an SVM approach
INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY (ISSN 1861-6429)
Artículo
Zuluaga M, Orkisz M, Delgado E, Dore V, Morales A, Hernandez M. (2009)
Adaptacioon del algoritmo MARACAS para la segmentacioon de la bifurcacioon de la arteria carotida y cuanti cacion de estenosis en imagenes TAC
Quinto Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica y V Seminario Internacional de Procesamiento y Análisis de Imágenes Médicas
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Orkisz M, Delgado E, Dore V, Morales A, Hernandez M. (2009)
Adaptación del algoritmo MARACAS para la segmentación de la bifurcación de la arteria carótida y cuantificación de estenosis en imágenes TAC
QUINTO SEMINARIO INTERNACIONAL DE INGENIERIA BIOMEDICA Y V SEMINARIO INTERNACIONAL DE PROCESAMIENTO Y ANALISIS DE IMÁGENES MEDICAS
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Orkisz M, Delgado E, Dore V, Morales A, Hernandez M. (2009)
Adaptations of MARACAS algorithm to the segmentation of the carotid bifurcation and stenosis quantification in CTA images
Midas Journal: MICCAI Workshop - 3D Segmentation in the Clinic: A Grand Challenge III
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Hernandez M, Orkisz M. (2009)
Evaluación del efecto de volumen parcial en imágenes TAC para el mejoramiento de la segmentación arterial coronaria
QUINTO SEMINARIO INTERNACIONAL DE INGENIERIA BIOMEDICA Y V SEMINARIO INTERNACIONAL DE PROCESAMIENTO Y ANALISIS DE IMÁGENES MEDICAS
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Orkisz M, Hernandez M. (2009)
Evaluation of partial volume effects in computer tomography for the improvement of coronary artery segmentation
INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY (ISSN 1861-6429)
Artículo
Morales A, Teillaud S, Gómez C, Hernandez M, Sanchez J. (2009)
Medición automática de la tasa de calcificación de corales en imágenes de microscopía confocal
Abstract book of the Latin American Informatics Conference
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Orkisz M, Hernandez M. (2009)
Mejoramiento de la segmentación arterial coronaria a través del modelamiento del volumen parcial en imágenes de TAC
Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095)
Artículo
Moreno S, Gomez S, Briceño J, Strulovic T, Pereira C, Hernandez M. (2009)
Segmentación del tejido óseo en el maxilar inferior para el estudio de la regeneración ósea
Quinto Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica y V Seminario Internacional de Procesamiento y Análisis de Imágenes Médicas
Capítulo en Memoria
Schaap M, Metz C, Van T, Van A, Weustink A, Mollet N, Bauer C, Bogunovic H, Castro C, Deng X, Dikici E, O’donnell T, Frenay M, Friman O, Hernandez M, Kitslaar P, Krissian K, Kuehnel C, Luengo M, Orkisz M, Smedby O, Styner M, Szymczak A, Tek H, Wang C, Warfield S, Zambal S, Zhang Y, Krestin G, Niessen W. (2009)
Standardized evaluation methodology and reference database for evaluating coronary artery centerline extraction algorithms
Medical Image Analysis (ISSN 1361-8415)
Artículo
Hernandez M, Zuluaga M, Lozano M, Prieto J, Douek P, Magnin I, Orkisz M. (2008)
Coronary centerline tracking in CT images with use of an elastic model and image moments
Midas Journal: IJ - MICCAI Workshop - Grand Challenge Coronary Artery Tracking
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Oscar, Pierrick, Hernandez M, Olivier, Sébastien. (2008)
Cortical Thickness Measurement from Magnetic Resonance Images Using Partial Volume Estimation
SPIE: Medical Imaging
Capítulo en Memoria
Nestor, Hernandez M, Stanislas, Maciej, Eduardo, Olivier, Jerôme, Lozano F, Camilo, Sanchez J. (2008)
Estudio no destructivo de los canales internos de octocorales por medio del análisis de imágenes biológicas y médicas
XIII Seminario Nacional de Ciencia y Tecnología del Mar.
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Marcela. (2008)
Medición del espesor de la membrana basal capilar glomerular (MBCG) en microfotografías electrónicas digitales
III Congreso de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica
Capítulo en Memoria
Orkisz M, Florez L, Hernandez M. (2008)
Models, algorithms and applications in vascular image segmentation
Machine Graphics and Vision (ISSN 1230-0535)
Artículo
Ochoa B, Hernandez M. (2008)
Segmentación de la membrana basal capilar glomerular en imágenes digitales para el cálculo del espesor medio
XXXIV Conferencia Latinoamericana de Informática (CLEI 2008)
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Dávila E, Uriza L, Hernandez M. (2007)
Carotid artery segmentation and characterization in 3D computed tomography (CT) images
INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY (ISSN 1861-6429)
Artículo
Fernández I, Angeles M, Zuluaga M, Uriza L, Hernandez M, Briceño J. (2007)
Carotid stenosis disease: use of mathematical and computational analysis as a diagnostic aid
ASAIO Journal (ISSN 1058-2916)
Artículo
Baltaxe M, Florez L, Hernandez M, Magnin I, Orkisz M. (2007)
Fast marching contours for the segmentation of vessel lumen in CTA cross-sections
IEEE EMBS Annual International Conference
Capítulo en Memoria
Florez L, Baltaxe M, Hernandez M, Vincent F, Doeuk P, Orkisz M. (2007)
Fast marching level-sets for the extraction of vascular cross-sectional contours in CT angiography images
Computer-Assisted Radiology and Surgery (ISSN 1861-6410)
Artículo
Cantor D, Orkisz M, Uriza L, Hernandez M. (2007)
Generación de modelos arteriales tridimensionales a partir de imágenes de resonancia magnética (IRM)
Libro de Resúmenes Del Xxix Congreso Colombiano de Radiología (ISSN 1909-5112)
Artículo
Cantor D, Arias J, Uriza L, Hernandez M. (2007)
Modelamiento en 3D de patologías vasculares a partir de imágenes de resonancia magnética sustraída
Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095)
Artículo
Hernandez M, Uriza L. (2007)
Procesamiento de imágenes y diagnóstico médico: experiencia Uniandes- Hospital San Ignacio
Cuarto Seminario de Ingenierìa Biomédica
Capítulo en Memoria
Carrillo J, Hernandez M, Dávila E, Orkisz M. (2007)
Recursive tracking of vascular tree axes in 3D medical images
INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY (ISSN 1861-6429)
Artículo
Angeles M, Hernandez M, Uriza L, Briceño J. (2006)
Activación plaquetaria en presencia de estenosis carotídea: modelo computacional y experimental
Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095)
Artículo
Carrillo J, Hernandez M, Orkisz M. (2006)
Automatic vascular tree segmentation
XXXII Conferencia Latinoamericana de Informática
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Sergio, Luis, Hernandez M. (2006)
Dinámica cardiovascular: Estenosis carotídea
XVIII Congreso de la Sociedad Ibero Latinoamericana de Neuroradiología
Capítulo en Memoria
Angeles M, Arias J, Uriza L, Hernandez M, Briceño J. (2006)
Evaluación de riesgo asociado a activación plaquetaria en presencia de estenosis carotídea: modelo computacional y experimental
Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095)
Artículo
Hernandez M, Serfaty J, Maghiar A, Mansard C, Orkisz M, Magnin I, Douek P. (2006)
Evaluation of semi-automatic arterial stenosis quantification
INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED RADIOLOGY AND SURGERY (ISSN 1861-6429)
Artículo
Arias J, Zuluaga M, Hernandez M, Briceño J. (2006)
Hemodynamics of carotid stenosis: a diagnostic image characterization and computational study
ASAIO Journal (ISSN 1058-2916)
Artículo
Cancino S, Pastrana F, Briceño J, Hernandez M. (2006)
Segmentación de arteriolas en la microcirculación de hemosustitutos para la medición de la variación en el tiempo de su diámetro mediante el procesamiento de imágenes
XXXII Conferencia Latinoamericana de Informática
Capítulo en Memoria
Carrillo J, Hernandez M, Dávila E, Orkisz M. (2006)
Segmentación y visualización arterial en ARM y TAC 3D
Libro de Resúmenes Del Xxix Congreso Colombiano de Radiología (ISSN 1909-5112)
Artículo
Carrillo J, Hernandez M, Dávila E, Orkisz M. (2006)
Segmentación y visualización arterial en arm y tc
Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095)
Artículo
Hernandez M, Or?owski P, Piatkowska E, Bogorodzki P, Orkisz M. (2006)
Vascular centerline extraction in 3D MR angiograms for phase contrast MRI blood flow measurement
Computer-Assisted Radiology and Surgery (ISSN 1861-6410)
Artículo
Carrillo J, Hernandez M, Dávila E, Orkisz M. (2006)
Vascular tree extraction from 3D images
Computer-Assisted Radiology and Surgery (ISSN 1861-6410)
Artículo
Hernandez M, Orkisz M, Douek P, Magnin I. (2005)
Assessment of carotid artery stenoses in 3D contrast-enhanced magnetic resonance angiography, based on improved generation of the centerline
Machine Graphics and Vision (ISSN 1230-0535)
Artículo
Lamus C, Uriza L, Hernandez M. (2005)
Desarrollo de una metodología semiautomática para la detección de los contornos de la pared de la arteria carótida en imágenes ultrasónicas en modo M
II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica
Capítulo en Memoria
Arias J, Angeles M, Hernandez M, Uriza L, Briceño J. (2005)
Efecto del grado de estenosis y la viscosidad en el nivel de activación plaquetaria a través de una estenosis de la arteria carótida: Desarrollo de un modelo computacional 2D
II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica
Capítulo en Memoria
Arias J, Angeles M, Uriza L, Hernandez M, Briceño J. (2005)
Efecto del grado de estenosis y la viscosidad sanguínea en el nivel de activación plaquetaría en la arteria carótida: Desarrollo de un modelo computacional
Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095)
Artículo
Arias J, Hernandez M, Uriza L, Briceño J, Nieto E. (2005)
Effect of stenosis severity and blood viscosity on platelet activation index: a computational study on a 2D carotid bifurcation
Summer Bioengineering Conference
Capítulo en Memoria
Cancino S, Uriza L, Hernandez M. (2005)
Estado del arte tecnológico, necesidades y prioridades en las áreas de procesamiento de imágenes diagnósticas, telemedicina y sistemas de información hospitalaria
Congreso Colombiano de Radiología
Capítulo en Memoria
Carrillo J, Orkisz M, Hernandez M. (2005)
Extraction of 3D vascular tree skeletons based on the analysis of connected components evolution
11th Int. IAPR Conf. Computer Analysis of Images and Patterns (CAIP 2005)
Capítulo en Memoria
Douek P, Hernandez M, Orkisz M. (2005)
Image Processing in Contrast-Enhanced MR Angiography
Magnetic Resonance Angiography (ISBN 978-88-470-0266-1)
Capítulo de Libro
Briceño J, Salazar A, Hernandez M, Amaya L, Cavelier G, Cabrales P. (2005)
Ingeniería Biomédica. Los rastros del camino.
Revista De Ingeniería (ISSN 0121-4993)
Artículo
Cancino S, Piedrahita G, Hernandez M. (2005)
Medición del diámetro de un vaso sanguíneo en la microcirculación con hemosustitutos
II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Orlowsky P, Piatkowska E, Bogorodzki P, Orkisz M. (2005)
Optimisation de la sélection du plan d acquisition pour la mesure du flux sanguin par l IRM de contraste de phase, utilisant l extraction de l axe vasculaire dans les images d angiographie par résonance magnétique 3D
Forum Recherche en GBM
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Orkisz M, Orlowsky P, Janko E, Bogorodzki P. (2005)
Optimisation de la sélection du plan d¿acquisition pour la mesure du flux sanguin par l¿IRM de contraste de phase, utilisant l¿extraction de l¿axe vasculaire dans les images d¿angiographie par résonance magnétique 3D
Forum Recherche en GBM
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Iván S, Felipe L, Hernandez M. (2005)
Segmentación vascular y caracterización de placas ateroscleróticas en imágenes de tomografía computarizada 3D
XXXI Conferencia Latinoamericana de Informática
Capítulo en Memoria
Zuluaga M, Mesa S, Uriza L, Hernandez M. (2005)
Segmentación y caracterización de la arteria carótida enescanografías 3D
Revista Colombiana de Radiología (ISSN 0121-2095)
Artículo
Mesa S, Hernandez J, Uriza L, Hernandez M. (2005)
Sistema interactivo de segmentación de imágenes tridimensionales del hígado humano
II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Orlowsky P, Piatkowska E, Bogorodzki P, Orkisz M. (2005)
Vascular centerline extraction in 3D MR angiograms to optimize acquisition plane for blood flow measurement by phase contrast MRI
Computer Assisted Radiology and Surgery
Capítulo en Memoria
Uriza L, Arias J, Nieto E, Hernandez M, Briceño J. (2004)
Desarrollo de un modelo computacional para estudio de la enfermedad arteriosclerótica carotídea
XXIX Congreso Colombiano de Radiología
Capítulo en Memoria
Lamus C, Nieto E, Hernandez M. (2004)
Detección semiautomática de contornos en imágenes de ecocardiografía modo M
Revista De Ingeniería (ISSN 0121-4993)
Artículo
Arias J, Caicedo V, Nieto E, Hernandez M, Uriza L, Briceño J. (2004)
Estudio de la hemodinámica a través de una estenosis de la bifurcación de la arteria carótida y su influencia en las observaciones clínicas: Protocolo de adquisición de imágenes y simulación
II Congreso internacional de la regiòn andina IEEE (Andescon)
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Briceño J, Em N, Salazar A, Torres J, Hernandez J, Tabima D. (2004)
Relación ingeniería, biología y medicina: lineamientos generales en este campo para la actividad académica de la Facultad de Ingeniería de la Universidad de los Andes
Revista De Ingeniería (ISSN 0121-4993)
Artículo
Hernandez M, Orkisz M, Magnin I, Douek P. (2002)
Automated generation of vessel centerlines and volumetric assessment of stenoses from MRA images
XIII Int. Workshop on MRA
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Orkisz M, Puech P, Mansard C, Douek P, Magnin I. (2002)
Computer Assisted Analysis of 3D MRA Images
Radiographics : a review publication of the Radiological Society of North America, Inc (ISSN 0271-5333)
Artículo
Orkisz M, Hernandez M. (2002)
Développement récent dans le traitement d'images : principes des techniques de segmentation
Angiographie par Résonance Magnétique (ISBN 2294003438)
Capítulo de Libro
Orkisz M, Hernandez M. (2002)
From inertia matrix to the analysis of vascular pathologies
Int. Conf. Computer Vision and Graphics
Capítulo en Memoria
Hernandez M. (2002)
PhD Thesis: Segmentation anisotrope pour la quantification en imagerie vasculaire par résonnance magnétique
Otro
Orkisz M, Hernandez M. (2002)
Podstawy technik segmentacji stosowanych w przetwarzaniu obrazów 3D naczyn krwionosnych
Polska Akademia Nauk. Biocybernetyka i Inzynieria Biomedyczna (ISBN 838767463X)
Capítulo de Libro
Hernandez M, Orkisz M, Magnin I, Douek P. (2002)
Quantification de la sténose artérielle dans des images ARM 3D fondée sur l'extraction automatique de l'axe central du vaisseau
Journal de Radiologie (ISSN 0221-0363)
Artículo
Marchand B, Douek P, Robert P, Corot C, Roux J, Adeleine P, Hernandez M, Crémillieux Y, Orkisz M, Canet E. (2002)
Standardized MR protocol for the evaluation of MRA sequences and/or contrast agents effects in high-degree arterial stenosis analysis.
Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology, and Medicine (ISSN 0968-5243)
Artículo
Orkisz M, Hernandez M, Douek P, Magnin I. (2001)
Advances in image processing techniques applied to 3D MRA images enhancement, segmentation and quantification - A survey and contributions.
Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology, and Medicine (ISSN 0968-5243)
Artículo
Mansard C, Hernandez M, Orkisz M, Puech P, Chaabane L, Serfaty J, Magnin I, Douek P. (2001)
Automatic image segmentation and stenosis quantification applied to MRA and to high resolution MR images
2nd Int. Workshop on Coronary MR and CT Angiography
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Orkisz M, Mansard C, Anwander A, Neyran B, Roux J, Boix E, Magnin I, Douek P. (2001)
Maracas (MAgnetic Resonance Angiography Computer ASsisted Analysis): An Interactive Software for Visualization and Analysis of Blood Vessels in 3D MRA Providing Automatic Quantification of the Arterial Stenosis
Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology, and Medicine (ISSN 0968-5243)
Artículo
Orkisz M, Hernandez M. (2001)
Models for 3D vascular image analysis
Journal of Medical Informatics and Technologies (ISSN 1642-6037)
Artículo
Marchand B, Douek P, Corot C, Roux J, Adeleine P, Hernandez M, Orkisz M, Crémillieux Y, Canet E. (2001)
Value of MRA Sequences and Contrast Agents For the Evaluation of High-Degree Stenosis: A Phantom Study.
9th ISMRM (International Society for Magnetic Resonance in Medicine) Annual Meeting
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Anwander A, Orkisz M, Roux J, Douek P, Magnin I. (2000)
A deformable vessel model with single point initialization for segmentation, quantification and visualization of blood vessels in 3D MRA
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2000
Capítulo en Memoria
Orkisz M, Hernandez M, Douek P, Magnin I. (2000)
Advances of blood vessel morphology analysis in 3D magnetic resonance images
Machine Graphics and Vision (ISSN 1230-0535)
Artículo
Marchand B, Hernandez M, Orkisz M, Douek P. (2000)
Diagnostic des Sténoses de l'Artère Rénale en Angiographie par Résonance Magnétique et Appréciation du Degré de Sténose.
Journal des Maladies Vasculaires (ISSN 0398-0499)
Artículo
Hernandez M, Orkisz M, Pierre J, Magnin I, C P. (2000)
Maracas (MAgnetic Resonance Angiography Computer ASsisted analysis): Logiciel de visualisation et de traitement d'images ARM 3D
Journal de Radiologie (ISSN 0221-0363)
Artículo
Orkisz M, Hernandez M, Douek P. (1999)
Automatic Vessel Axis Extraction and Equivalent Diameter Estimation from 3D MRA Data
Acta Radiologica (ISSN 0284-1851)
Artículo
Hernandez M, Orkisz M, Pierre J, C P. (1999)
Inertia-based vessel axis extraction and stenosis quantification in 3D MRA images
CARS'99
Capítulo en Memoria
Orkisz M, Hernandez M. (1998)
Développements récents dans le traitement d'images : principes des techniques de segmentation d'images vasculaires 3D
2-èmes Journées du Groupe de Recherche et de Réflexion en Angiographie par Résonance Magnétique
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Quintero A. (1996)
ORCA: Modelo de un Sistema de Soporte a Procesos de Negociación en Grupo
XXII Conferencia Latino-Americana de Informatica
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Alejandro L. (1994)
GENES: Sistema Experto en el Diagnostico de Errores Innatos del Metabolismo
III Congrès Latino-Américain de Genétique
Capítulo en Memoria
Hernandez M, Rodriguez M. (1994)
Hacia la Ingenieria de Software Cooperativo
XIV Jornadas de Informatica
Capítulo en Memoria
Títulos académicos
Docteur De L'Institut National Des Sciences Apliquees De Lyon Spécialité: Images Et Systemes
Doctorado
Institut National Des Sciences Apliquees De Lyon
2003
Francia
Diplome D'Études Approfondies Formation Genie Biologique Et Médical
Maestría
Institut National Des Sciences Apliquees De Lyon
1999
Francia
Magíster En Ingeniería De Sistemas Y Computación
Maestría
Universidad De Los Andes
1996
Colombia
Ingeniera De Sistemas Y Computación
Título de grado
Universidad De Los Andes
1993
Colombia
Proyectos
- 2011
- DETENCION DE ANOMALIAS EN ARBOLES VASCULARES
Duración: 36 meses
PRY-585
Modelo del arbol vascular coronario a partir de imagnes TAC 3D Y T para cuantificacion del porcentaje de estenosis coronaria en presencia de palcas altamente calificadasDuración: 24 meses
PRY-516
- Segmentacion del arbol coronario en imagenes TAC 3D+T para la cuantificacion del porcentaje de estenosis en presencia de placas altamente calcificadas
Duración: 18 meses
PRY-577
- 2010
- 2009
- 2004
